Do sezóny 2009/2010 vstoupilo Dynamo posíleno o 2 hráče, a to o Jiřího Modrianského, který se tak stal 3.gólmanem Dynama a zároveň také útočníkem v případě potřeby, a také o Jiřího Petříka, který se zabydlel v obraně. Ten však nakonec odehrál pouhé 3 zápasy, ve kterých si připsal 2 body za 2 asistence a od té doby už za Dynamo nenastupuje. Dynamo vstoupilo do sezóny zápasem s AC Hodolany, ve velmi vyrovnaném zápase nakonec Tandlerův gól a neproměněná penalta znamenaly porážku 1:2. Tu si však Dynamo odčinilo v Bukovanech, když velice překvapivě porazilo Investol 3:1. Poté přišla domácí výhra nad Kolibou Bukovany 3:2 a těsná prohra s týmem Mlha a Dynamo tak ze začátku sezóny okupovalo přední příčky v tabulce. To se ještě zlepšilo po domácí výhře nad outsiderem naší divize týmem Přáslavští lvi, které Dynamo sice těsně, přesto ale porazilo 2:0. Poté ovšem přišla první tvrdá lekce od týmu Mix J. a následně také porážka od Čendy, která znamenala propad do spodních pater tabulky. Dynamo však poté opět překvapilo v Mrsklesích, kde v rozpadlé sestavě dokázalo vybojovat vítězství 3:1. Poté ale přišla velmi smolná porážka s Kanonýry, kteří o svém vítězství rozhodli až 20 sekund před koncem. Dynamo poté 2 zápasy ani neskórovalo, nejdřív nejtěsnějším možným výsledkem prohrálo v Přáslavicích s Atlantou a poté Roko Samotišky připravilo Dynamu nejhorší prohru podzimu 0:7. Radost si Bystrovany neudělaly ani v posledním zápase s 1. týmem tabulky, se kterým prohráli 2:7 a po podzimu jim tak patřila 10.příčka s 8 body.
Přes zimní pauzu v týmu skončil Jan Stejskal, kterého nahradil v útoku Lukáš Pudil, posila z Investolu Bukovany. A hned v prvním zápase, který se nakonec ukázal jako velmi důležitý, se také on zapříčinil o výhru nad AC Hodolany 3:1. Pak ale přišla porážka s Investolem Bukovany 3:6 a hodně nečekaná prohra s Kolibou Bukovany 1:2. Ani proti Mlze si Dynamo moc sebevědomí nezlepšilo, sice vstřelilo 4 góly, ale 6 jich inkasovalo a opět tak prohrálo. Teprve s týmem Přáslavští lvi přišel další dvoubodový zisk, navíc výhra 7:0 je zatím nejvyšší dosaženou výhrou v historii Dynama. Následovala však série 3 vysokých porážek v řadě od Mix J., Čendy a Mrskles. Dynamo se opět probralo s Kanonýry, se kterými sehrálo velmi pěknou partii, ale nakonec prohrálo 4:1. V posledním domácím zápase hostilo Dynamo Atlantu Přáslavice a v otevřeném zápase vybojovalo pro konečné účtování velmi důležitý bod po remíze 1:1. Den nato mohlo Dynamo získat další bodík, ale v Samotiškách podlehlo těsně 2:3. V posledním zápase v Mrsklesích s jistým vítězem ligy M-Contaktem už ani jednomu týmu o nic nešlo. Domácí si rozlučku užili a vyprovodili Dynamo výsledkem 8:2.
Dynamo se tak nakonec umístilo na 10. místě se ziskem 13 bodů, což je o 1 bod lepší než v loňské sezóně. Uvidíme, jak to bude vypadat v následující sezóně, ve které na Dynamo v lize krom tradičních soupeřů a týmu sestupujících ze 3. ligy čekají také 2 nováčci. Tým po jarní části navíc opustil Lukáš Pudil, takže Dynamo bude mít pro novou sezónu připraveno celkem 8 hráčů.