Do sezóny 2013/2014 vstoupilo Dynamo po dlouhých letech bez jedné ze svých tradičních opor v obraně, a to Plesky, který přestoupil do Atletica Bystrovany. Jako náhrada již však byl připraven z minulé sezóny ozkoušený Masař. Začátek sezóny se ale Dynamu vůbec nevyvedl, první utkání prohrálo 1:3 s OSŽ Commando, i když hrálo lépe. Následovalo dalších 5 zápasů, ve kterých Dynamo nebylo ani blízko bodovému úspěchu, postupně prohrálo s týmy Sportbar Sigma HBL a Hejčínští berani (s oběma týmy 2:6), dále M-Contakt (5:9), Pošta (2:5) a Naschrot (2:4). Až v 7.kole Dynamo potvrdilo, že se mu v Bukovanech výrazně daří, a přehrálo místní Topmont Bukovany 5:2. Následovala nejvyšší výhra Dynama v historii, když výsledkem 10:2 porazilo Kenny juniors. Dvěma góly se o tuto výhru zasloužila nová posila Smoleň. Pak však opět přišel útlum Dynama a prohry s AC Rapid (1:5) a OKL team (2:3). Na zápase proti Second Wave Dynamo poprvé představilo nové dresy a křest to byl vítězný (5:3). Podzim však Dynamo zakončilo porážkou s Dominem (1:3). V dohrávaném podzimním kole čekal na jaře poslední tým tabulky Leaders, Dynamo jej smetlo 5:0. Následně si střihlo 2 utkání ve 2 dnech po sobě ve Slavoníně, nejprve prohrálo 2:6 s OSŽ Commando, aby den nato přišlo v posledních vteřinách o výhru nad Sportbar Sigma HBL a bralo nakonec jen bod za remízu 5:5. Dynamo pak čekal čtyřboj s prvním kvartetem týmů tabulky, které se celé jaro praly o postup. Se třemi z nich sehrálo vyrovnané partie a nebylo daleko od zisku bodu, ale prohrálo jak s Poštou (2:3), Hejčínskými berany (2:3) i s Naschrot (3:4). Mezitím prohrálo Dynamo i s M-Contaktem (3:7). V zápase proti Topmontu Bukovany pak kvůli vyloučení z předchozího zápasu nemohl nastoupit Hebelka, kterého zaskočil Marhons, ale jeho premiéra vítězná nebyla (2:3). Dynamo následně silou vůle urvalo výhru nad tápajícím týmem Kenny juniors (4:3). Pak však opět přišla série porážek s týmy AC Rapid (4:6), kdy Dynamo neudrželo nadějné vedení 4:1, poté s OKL team (2:7), Second Wave (2:5) a v předposledním utkání sezóny také s Dominem (3:5). V posledním utkání sezóny však Dynamo podruhé v sezóně překonalo svůj nejlepší výsledek výhrou nad Leaders 10:1, čímž uzavřelo 9.sezónu. Dynamo se také opět představilo na turnaji FC HCO, kde se mu ovšem nedařilo střelecky a po dvou prohrách ve skupině v poměru 0:2 obsadilo nakonec až 10.místo.